استنكر الاتحاد العالمي لعلماء المسلمين الصمت العالمي تجاه واقعة جريمة قتل الفتى محمد أبو خضير قائلاً إنه "ينذر بخطر كبير على القضية الفلسطينية". ودعا الاتحاد في بيانٍ لها الخميس رفض تلك الاعتداءات العنصرية ضد العرب والمسلمين، والتصدي لها على كافة الأصعدة. وأكد على كامل الحق الفلسطيني في الدفاع عن أرضه المحتلة، ومقاومة المحتل بشتى الطرق المتاحة، دون استثناء، وفق قواعد الشرع الإسلامي ، وقواعد ومبادئ القانون الدولي. وقال الاتحاد العالمي إن ما تقوم به سلطة الاحتلال على الأرض الفلسطينية تمثل خطوات استعراضية متطرفة؛ إرضاء لمطالب دموية من محتل قاتل. ودعا الاتحاد الأمة الإسلامية والعربية لنصرة الشعب الفلسطيني وحقوقه العادلة والمقدسات.